据资料记载，秦岭地区虽然没有国家一级保护植物，但二级保护植物有许多，比较出名的有独叶草（Kingdonia uniflora，毛茛科，著名孓遗植物）、星叶草（毛茛科 、水青树（Tetracentron sinensis，水青树科）、连香树（Cercidiphyllum japonicum，连香树科）、山白树（Sinowilsonia henryi，金缕梅科）、翅果油树（Elaeagnus molis，胡颓子科）、香果树（Emmenopterys henryi，茜草科）、太白红杉（Larix potaninii var．chinensis，松科）、狭叶瓶尔小草（Ophioglossum thermale，瓶尔小草科）等。
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